系統(tǒng)生物學基礎

第1章 系統(tǒng)生物學：從系統(tǒng)水平認識生物系統(tǒng)
1.1 引言
1.2 測量技術與實驗方法
1.3 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)鑒定
1.4 系統(tǒng)行為分析
1.5 生物學系統(tǒng)的魯棒性
1.6 系統(tǒng)組計劃
1.7 系統(tǒng)生物學的影響
1.8 結(jié)論
參考文獻
第Ⅰ部分 先進測量系統(tǒng)
第2章 四維顯微方法自動化獲取細胞系及線蟲早期胚胎形成分析
第Ⅱ部分 基因表達數(shù)據(jù)的反向工程和數(shù)據(jù)挖掘
第3章 基于DBRF方法從大規(guī)模穩(wěn)態(tài)基因表達數(shù)據(jù)推測基因網(wǎng)絡
第4章 與癌癥相關的基因表達矩陣分析
第5章 利用遺傳規(guī)則實現(xiàn)從觀測數(shù)據(jù)到代謝通路的自動反向工程
第Ⅲ部分 建模和仿真軟件
第6章 ERATO系統(tǒng)生物學工作平臺：多尺度與多理論的系統(tǒng)生物學仿真集成環(huán)境
第7章 信號轉(zhuǎn)導自動模型的生物及在MAP-激酶途徑中的應用
第8章 功能基因組學數(shù)據(jù)的大型生物系統(tǒng)建模：參數(shù)估計
第Ⅳ部分 細胞仿真
第9章 邁向虛擬生物實驗室
第10章 計算細胞生物學——隨機方法
第11章 細胞的計算機仿真：人體紅細胞模型及其應用
第Ⅴ部分 系統(tǒng)水平分析
第12章 構(gòu)建生物信號轉(zhuǎn)導途徑的數(shù)學模型：魯棒性分析
第13章 動態(tài)平衡和信號轉(zhuǎn)導中普遍存在的調(diào)節(jié)機制：雙相響應調(diào)節(jié)與正反饋的結(jié)合
第14章 Rho激酶途徑和肌球蛋白輕鏈激酶途徑在肌球蛋白輕鏈磷酸化中的不同作用：動力學仿真研究