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內(nèi)容簡介

　　在當今的信息時代，失去信息的利用，等于失去許多重要的一切?！痘赪WW的生物信息學應用指南》則是教會從事生物、醫(yī)學等生命科學的人們?nèi)绾卫脟H互聯(lián)網(wǎng)掌握更多、更前衛(wèi)的生物信息。環(huán)球網(wǎng)（WWW）是當前國際互聯(lián)網(wǎng)中重要的信息網(wǎng)，它涵蓋核苷酸和蛋白質(zhì)序列查詢、遞交、基因的計算機克隆、序列相似性搜索，蛋白質(zhì)基序和結(jié)構(gòu)域識別、進化樹構(gòu)建、蛋白三維同源模型構(gòu)建以及基因數(shù)字化差異表達分析等主流生物信息學的應用，以上內(nèi)容在本書中均作了詳細闡述。同時，《基于WWW的生物信息學應用指南》最大的特色是結(jié)合了中南大學腫瘤研究所以及腫瘤基因組研究中心精心設計了多達43個具體生物信息學應用練習題，并按實例進行深入淺出的表達，講解清晰，使讀者能夠直接參考這些練習來解決科研中的實際問題，避免不必要的重復研究，少走彎路，有助于提高我國生物科學研究水平。本書很適合從事生物學、醫(yī)學、分子生物學、腫瘤學、病理生理學等專業(yè)的科研人員及工作者閱讀參考，也可作為本科、研究生教育教材使用。

作者簡介

暫缺《基于WWW的生物信息學應用指南》作者簡介

圖書目錄

第1章引論
1.1 基因組／蛋白質(zhì)組信息學
1.1.1 基因組信息學
1.1.2 蛋白質(zhì)組信息學
1.2 互聯(lián)網(wǎng)與生物信息學
1.2.1 互聯(lián)網(wǎng)基礎
1.2.2 生物信息學數(shù)據(jù)庫
1.2.3 生物信息學軟件
1.3 生物信息學門戶網(wǎng)站
1.3.1 美國國立生物技術信息中心
1.3.2 歐洲生物信息研究所
1.3.3 瑞士蛋白質(zhì)分析專家系統(tǒng)
1.3.4 北京大學生物信息中心
第2章序列查詢和遞交
2.1 Entrez查詢系統(tǒng)
2.1.1 簡介
2.1.2 Entrez系統(tǒng)的基本查詢功能
2.1.3 查詢策略
2.2 LocusLink查詢系統(tǒng)
2.3 SRS查詢系統(tǒng)
2.4 序列信息遞交
第3章序列相似性搜索
3.1 概述
3.1.1 序列相似性與同源性
3.1.2 全局和局部序列比對
3.1.3 比對分數(shù)矩陣和空位罰分
3.1.4 比對算法
3.1.5 比對分數(shù)的統(tǒng)計學評價
3.2 序列相似性搜索
3.2.1 BLAST
3.2.2 Fasta
第4章基因識別
4.1 基因組外顯子預測
4.1.1 從頭預測
4.1.2 相似性比較預測
4.2 基于EST的基因鑒定
第5章多序列比對
5.1 ClustaIW
5.2 BOXSHADE
第6章蛋白質(zhì)基序和結(jié)構(gòu)域識別
6.1 PROSITE patterns和PROSITE profile
6.2 Pfam和Prodom
6.3 SMART
6.4 Blocks和PRINTS
6.5 InterPro
第7章進化樹構(gòu)建
7.1 PHYLIP軟件包
7.2 ClustaIW程序
第8章蛋白三維同源模型構(gòu)建
第9章基因數(shù)字化差異表達分析
第10章核苷酸序列的一般分析
10.1 序列格式轉(zhuǎn)換
10.2 互補和反向序列的轉(zhuǎn)換
10.3 核苷酸序列統(tǒng)計
10.4 序列注釋
10.5 序列翻譯與ORF預測
10.5.1 EBI的Transeq
10.5.2 ExPASy的Translatetool
10.5.3 0RF識別
10.6 限制性酶切分析
10.7 質(zhì)粒作圖
10.8 引物設計
10.8.1 通用引物在線設計程序Primer3
10.8.2 簡并引物在線設計程序GeneFisher
第11章蛋白序列的其他特征分析
11.1 氨基酸基本理化特性分析
11.2 蛋白的亞細胞定位
11.3 膜蛋白跨膜區(qū)預測
11.4 蛋白序列二級結(jié)構(gòu)預測
11.4.1 JPred預測服務器
11.4.2 PredictProtein預測服務器
第12章整合的序列分析
第13間蛋白質(zhì)組信息學