番茄基因組設(shè)計(jì)育種

前言
1 番茄智能型育種面臨的主要挑戰(zhàn)
1.1 番茄產(chǎn)量
1.2 番茄果實(shí)品質(zhì)
1.2.1 番茄果實(shí)營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)
1.2.2 番茄果實(shí)感官品質(zhì)
1.2.3 適度脅迫對(duì)番茄果實(shí)品質(zhì)的影響
1.3 番茄對(duì)生物脅迫的抗性及對(duì)非生物脅迫的耐受性
1.3.1 番茄對(duì)生物脅迫的抗性
1.3.1.1 番茄病蟲害的種類
1.3.1.2 氣候變化對(duì)番茄病蟲抗性的影響
1.3.1.3 番茄對(duì)新病蟲害的抗性
1.3.2 番茄對(duì)非生物脅迫的耐受性
1.3.2.1 水分脅迫
1.3.2.2 鹽脅迫
1.3.2.3 溫度脅迫
1.3.2.4 礦質(zhì)營(yíng)養(yǎng)脅迫
1.3.3 番茄對(duì)綜合脅迫的耐受性
2 番茄的遺傳和基因組資源
2.1 番茄的遺傳資源
2.1.1 番茄的起源及其野生種
2.1.2 番茄的種質(zhì)資源庫(kù)
2.1.3 番茄的突變體庫(kù)
2.2 番茄的分子標(biāo)記、基因和QTL
2.2.1 番茄分子標(biāo)記的發(fā)展
2.2.2 番茄數(shù)量性狀QTL
2.2.3 番茄表型解析專用群體庫(kù)
2.2.4 番茄抗病基因與QTL
2.2.4.1 番茄抗病基因與QTLs資源的發(fā)掘
2.2.4.2 番茄抗病基因與QTLs的染色體分布
2.2.4.3 番茄抗病基因與QTLs的分子基礎(chǔ)
2.3 番茄的基因組資源
2.3.1 番茄參考基因組序列
2.3.2 番茄基因組重測(cè)序
2.4 番茄的SNP標(biāo)記
2.4.1 番茄SNP的發(fā)現(xiàn)
2.4.2 番茄SNP微陣列芯片
2.4.3 番茄基因型填充
2.5 番茄的遺傳多樣性分析
2.6 番茄中已克隆的基因和QTL
2.7 番茄新的基因和QTL鑒定
2.8 番茄全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.8.1 番茄全基因組關(guān)聯(lián)分析的條件
2.8.2 番茄全基因組關(guān)聯(lián)的Meta分析
2.9 番茄非生物脅迫耐受性的遺傳解析
2.9.1 番茄基因型與環(huán)境互作（G×E）的遺傳調(diào)控
2.9.2 番茄嫁接對(duì)脅迫耐受性的影響
2.10 番茄組學(xué)分析
2.10.1 番茄代謝組學(xué)分析
2.10.2 番茄轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析與eQTL定位