R圖形化數(shù)據(jù)分析

前言 ix
第一部分　開始使用 R
第 1 章　R 基礎(chǔ) 2
1．1　下載軟件 2
1．2　嘗試一些簡(jiǎn)單的任務(wù) 2
1．3　用戶界面 5
1．4　安裝包：GUI 界面 6
1．5　數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 6
1．6　樣本數(shù)據(jù)集 7
1．7　工作目錄 9
1．8　將數(shù)據(jù)導(dǎo)入 R 9
1．8．1　命令行輸入 10
1．8．2　使用數(shù)據(jù)編輯器 11
1．8．3　從外部文件讀取 13
1．9　獲取腳本 18
1．10　用戶自定義函數(shù) 20
1．11　開始令人享受的事 21
第 2 章　R 圖概述 24
2．1　圖表導(dǎo)出 24
2．2　探索性圖表和展示性圖表 25
2．3　R 圖形系統(tǒng) 28
2．3．1　基本圖形和網(wǎng)格 28
2．3．2　 lattice 28
2．3．3　 ggplot2 30
2．3．4　包的特殊應(yīng)用程序 / 圖表 31
2．3．5　用戶自定義圖表函數(shù) 31
第二部分　單變量圖
第 3 章　帶狀圖 34
3．1　一種簡(jiǎn)單的圖 34
3．2　數(shù)據(jù)可以漂亮 40
3．2．1　練習(xí) 3-1 43
3．2．2　練習(xí) 3-2 43
第 4 章　點(diǎn)圖 44
第 5 章　箱線圖 50
5．1　箱線圖 50
5．2　再次訪問 Nimrod 54
5．3　美化數(shù)據(jù) 56
5．3．1　練習(xí) 5-1 59
5．3．2　練習(xí) 5-2 59
第 6 章　莖葉圖 60
第 7 章　直方圖 63
7．1　簡(jiǎn)單直方圖 63
7．2　帶第二個(gè)變量的直方圖 66
7．2．1　練習(xí) 7-1 70
7．2．2　練習(xí) 7-2 70
第 8 章　核密度圖 71
8．1　密度估計(jì) 71
8．1．1　選擇帶寬 73
8．1．2　比較兩個(gè)或多個(gè)密度圖 74
8．1．3　背景不是白色的 76
8．2　累積分布函數(shù) 76
8．2．1　練習(xí) 8-1 78
8．2．2　練習(xí) 8-2 78
第 9 章 條形圖 79
9．1　基礎(chǔ)條形圖 79
9．2　脊柱圖 82
9．3　條形圖的間距和方向 83
9．3．1　練習(xí) 9-1 86
9．3．2　練習(xí) 9-2 86
第 10 章　餅圖 87
10．1　普通餅圖 87
10．2　扇形圖 89
10．2．1　練習(xí) 10-1 90
10．2．2　練習(xí) 10-2 90
第 11 章　地毯圖 91
第三部分　雙變量圖
第 12 章　散點(diǎn)圖和折線圖 94
12．1　基礎(chǔ)散點(diǎn)圖 94
12．2　折線圖 99
12．3　模板 105
12．4　增強(qiáng)的散點(diǎn)圖 108
12．4．1　練習(xí) 12-1 111
12．4．2　練習(xí) 12-2 112
第 13 章　高密度圖 113
第 14 章　Bland-Altman 圖 121
第 15 章　QQ 圖 128
第四部分　多變量圖
第 16 章　散點(diǎn)圖矩陣和相關(guān)性分析圖 136
16．1　散點(diǎn)圖矩陣 136
16．2　相關(guān)性分析圖 141
16．3　混合定量變量和分類變量的廣義對(duì)矩陣 145
第 17 章　三維圖 149
17．1　三維散點(diǎn)圖 149
17．2　偽色圖 154
17．3　氣泡圖 155
17．3．1　練習(xí) 17-1 160
17．3．2　練習(xí) 17-2 160
第 18 章　協(xié)同圖 161
第 19 章　聚類分析：樹狀圖和熱圖 167
19．1　聚類分析 167
19．2　熱圖 172
19．2．1　練習(xí) 19-1 176
19．2．2　練習(xí) 19-2 176
19．2．3　練習(xí) 19-3 176
第 20 章　馬賽克圖 177
第五部分　現(xiàn)在該做些什么
第 21 章　拓展圖形化知識(shí)和 R 技能的資源 188
21．1　R 圖 188
21．2　通用繪圖原則 189
21．3　學(xué)習(xí)更多關(guān)于 R 的知識(shí) 189
21．4　用 R 做統(tǒng)計(jì) 189
附錄 A　參考文獻(xiàn) 191
附錄 B　R 的顏色 193
附錄 C　R Commander 圖形用戶界面 195
附錄 D　使用 / 引用的包 200
附錄 E　從 R 的外部導(dǎo)入數(shù)據(jù) 204
附錄 F　章節(jié)練習(xí)解答 209
附錄 G　故障排查：為什么我的代碼不工作 220
附錄 H　本書介紹的 R 函數(shù) 228
關(guān)于作者 238
關(guān)于封面 238