生物信息學(xué)學(xué)習(xí)指導(dǎo)及習(xí)題集（八年制配教）

第一章 生物序列資源
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)與數(shù)據(jù)資源
三、LICSC基因組瀏覽器與數(shù)據(jù)資源
四、EMBL-EBI數(shù)據(jù)庫(kù)與數(shù)據(jù)資源
五、重要的非編碼基因數(shù)據(jù)庫(kù)
復(fù)習(xí)思考題
一、名詞解釋
二、問(wèn)答題
答案與題解
第二章 序列比對(duì)
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、比對(duì)算法概要
三、數(shù)據(jù)庫(kù)搜索
四、比對(duì)軟件、參數(shù)與數(shù)據(jù)資源
五、比對(duì)技術(shù)的發(fā)展
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第三章 序列特征分析
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、DNA序列特征分析
三、蛋白質(zhì)序列特征分析
四、RNA序列與結(jié)構(gòu)特征分析
五、表達(dá)序列特征分析
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第四章 分子進(jìn)化分析
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、系統(tǒng)發(fā)生樹分析與重建
三、核苷酸和蛋白質(zhì)的適應(yīng)性進(jìn)化
四、分子進(jìn)化與生物信息學(xué)
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、問(wèn)答題
三、計(jì)算題
答案與題解
第五章 基因芯片數(shù)據(jù)分析
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、基因表達(dá)的測(cè)定平臺(tái)、數(shù)據(jù)庫(kù)
三、數(shù)據(jù)的預(yù)處理、差異表達(dá)分析
四、基因芯片數(shù)據(jù)的聚類或分類分析
五、基因表達(dá)分析的常用軟件
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、問(wèn)答題
三、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第六章 蛋白質(zhì)組與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的獲取與分析
三、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)
四、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
五、蛋白質(zhì)功能分析
六、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)異常與疾病
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第七章 基因注釋與功能分類
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、基因注釋數(shù)據(jù)庫(kù)
三、基因集功能富集分析
四、基因功能預(yù)測(cè)
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、問(wèn)答題
三、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第八章 轉(zhuǎn)錄調(diào)控的信息學(xué)分析
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的信息學(xué)預(yù)測(cè)方法
三、轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第九章 生物分子網(wǎng)絡(luò)和通路
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、生物分子網(wǎng)絡(luò)概述
二、生物分子網(wǎng)絡(luò)分析
三、生物分子網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第十章 計(jì)算表觀遺傳學(xué)
學(xué)習(xí)要點(diǎn)
內(nèi)容要點(diǎn)
一、引言
二、基因組的DNA甲基化
三、組蛋白修飾的表觀基因組
四、基因組印記
五、表觀遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和軟件
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
答案與題解
第十一章 復(fù)雜疾病的分子特征與計(jì)算分析
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、復(fù)雜疾病的分子特征與數(shù)據(jù)資源
三、復(fù)雜疾病的遺傳易感與遺傳定位分析
四、常用的集成軟件工具
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第十二章 非編碼RNA與復(fù)雜疾病
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、miRNA的特點(diǎn)及作用機(jī)制
二、miRNA靶基因預(yù)測(cè)
三、IncRNA及作用機(jī)制
四、ncRNA主要數(shù)據(jù)資源
五、ncRNA多態(tài)性分析
六、利用ncRNA表達(dá)譜研究復(fù)雜疾病
七、復(fù)雜疾病非編碼RNA的計(jì)算識(shí)別
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、問(wèn)答題
三、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第十三章 新一代測(cè)序技術(shù)與復(fù)雜疾病研究
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、新一代測(cè)序技術(shù)概述
三、DNA測(cè)序技術(shù)及應(yīng)用
四、RNA測(cè)序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析
五、ChIP-seq技術(shù)原理及分析方法
六、新一代測(cè)序技術(shù)在其他領(lǐng)域應(yīng)用
復(fù)習(xí)思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解
第十四章 藥物生物信息學(xué)
學(xué)習(xí)目標(biāo)
知識(shí)要點(diǎn)
一、引言
二、藥物靶標(biāo)的信息學(xué)識(shí)別
三、藥物基因組學(xué)及其臨床研究策略
四、藥物基因組相關(guān)生物信息資源
五、基于藥物基因組的個(gè)體化藥物治療
復(fù)習(xí)思考題
一、名詞解釋
二、選擇題
三、問(wèn)答題
四、上機(jī)實(shí)踐
答案與題解