染色質(zhì)與表觀遺傳調(diào)控

第一章 染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能
第一節(jié) 染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)
一、染色質(zhì)的基本單位——核小體
二、核小體的裝配與相位
三、染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)
第二節(jié) 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域及其相關(guān)元件
一、染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)域效應(yīng)
二、染色質(zhì)元件及其結(jié)合蛋白
第三節(jié) 染色質(zhì)的修飾與結(jié)構(gòu)重塑
一、染色質(zhì)的修飾及其意義
二、染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的分類和修飾特征
第四節(jié) 染色質(zhì)與表觀遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
結(jié)束語
參考文獻
第二章 核心組蛋白的修飾
第一節(jié) 組蛋白密碼
一、組蛋白修飾與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控
二、組蛋白修飾的生理與病理意義
第二節(jié) 組蛋白乙酰化修飾
一、組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶
二、天然核小體乙酰化復(fù)合物
三、組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶和FAT
四、組蛋白去乙酰基酶
第三節(jié) 組蛋白甲基化修飾
一、組蛋白賴氨酸甲基化
二、組蛋白精氨酸甲基化
三、組蛋白去甲基化
第四節(jié) 組蛋白磷酸化
一、組蛋白H3磷酸化
二、組蛋白H2B磷酸化
三、組蛋白H2A和組蛋白H4的磷酸化
第五節(jié) 組蛋白其他類型修飾
一、組蛋白泛素化修飾
二、組蛋白SUMO化修飾
三、組蛋白生物素化修飾
第六節(jié) 組蛋白修飾的網(wǎng)絡(luò)
一、組蛋白修飾的順式相互作用
二、組蛋白修飾的反式相互作用
三、組蛋白甲基化與DNA甲基化之間的相互作用
結(jié)束語
參考文獻
第三章 依賴于ATP的染色質(zhì)重塑復(fù)合物
第一節(jié) 概述
一、染色質(zhì)重塑復(fù)合物的組成
二、染色質(zhì)重塑復(fù)合物的作用機制
三、染色質(zhì)重塑復(fù)合物對基因轉(zhuǎn)錄的激活作用
四、染色質(zhì)重塑復(fù)合物參與抑制基因的轉(zhuǎn)錄
第二節(jié) SWI／SNF復(fù)合物家族
一、SWI／SNF復(fù)合物家族的組成
二、SWI／SNF復(fù)合物的結(jié)構(gòu)域及功能
三、不同的SWI／SNF復(fù)合物提供特定的功能
第三節(jié) ISWI復(fù)合物家族
一、ISWI復(fù)合物的功能
二、種類繁多的ISWI復(fù)合物
第四節(jié) Mi-2復(fù)合物家族
一、Mi-2的功能特異性
二、MBD2、MBD3與DNA甲基化
三、MTA蛋白家族與Mi-2／NuRD的功能特異性
第五節(jié) Ino80和SWRl染色質(zhì)重塑復(fù)合物
一、lno80和SWRl重塑復(fù)合物的亞基組成
二、參與組蛋白的交換
三、參與DNA損傷斷裂修復(fù)
第六節(jié) ATP依賴的染色質(zhì)重塑復(fù)合物與其他染色質(zhì)重塑機制的聯(lián)系
一、重塑機制協(xié)同激活轉(zhuǎn)錄
二、重塑機制協(xié)同抑制轉(zhuǎn)錄
結(jié)束語
參考文獻
第四章 真核基因組DNA的甲基化修飾
第一節(jié) 甲基化的基本概念
一、原核生物甲基化現(xiàn)象
二、真核生物胞嘧啶甲基化
第二節(jié) DNA甲基化對真核基因表達調(diào)控的作用
一、DNMT家族介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄抑制活性
二、MBD家族介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄阻遏機制
三、DNA甲基化排斥轉(zhuǎn)錄因子
四、DNA甲基化和組蛋白修飾協(xié)同參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控
第三節(jié) DNA甲基化在重大生命活動中的調(diào)控作用
一、DNA甲基化在重要生理活動中的調(diào)控作用
二、DNA甲基化在疾病中的調(diào)控作用
第四節(jié) 甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑在腫瘤治療中的作用
結(jié)束語
參考文獻
第五章 RNA與染色質(zhì)
第一節(jié) RNA干擾及其機制
一、RNA干擾的轉(zhuǎn)錄后沉默
二、siRNAs與miRNAs的聯(lián)系和區(qū)別
第二節(jié) RNAi介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄水平沉默
一、RNA指導(dǎo)的DNA甲基化
二、依賴RNAi的異染色質(zhì)形成
第三節(jié) RNA干擾的應(yīng)用
一、RNA干擾在基因功能研究上的應(yīng)用
二、RNA干擾在醫(yī)藥科學(xué)上的研究及應(yīng)用前景
結(jié)束語
參考文獻
附錄 輔助閱讀材料
一、染色質(zhì)免疫沉淀分析
二、全基因組定位技術(shù)
三、核小體相位分析
四、染色質(zhì)DNA酶I高敏感位點的檢測
五、體內(nèi)DNA足跡法
六、體外染色質(zhì)裝配
七、分離組蛋白變異體及修飾異構(gòu)體
八、電泳遷移率變更檢測法
九、DNA甲基化檢測方法
十、RNA干擾技術(shù)
十一、染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù)
索引