蛋白質分子結構

第1章緒論
1.1引言.
1.2蛋白質在生命過程中的作用
1.3蛋白質結構的一般概念
1.4蛋白質的基本組成單位
1.5多肽鏈
1.6多肽鏈的構象
1.7蛋白質的結構生物學
第2章蛋白質的結構層次
2.1蛋白質的基本結構單位
2.2維持和穩(wěn)定蛋白質高級結構的因素
2.3蛋白質的結構層次
2.4小結
參考文獻
第3章蛋白質的一級結構和二級結構
3.1蛋白質的一級結構
3.2蛋白質的二級結構
參考文獻
第4章蛋白質的超二級結構Motif
4.1連接多肽
4.2蛋白質中的超二級結構
4.3頻繁發(fā)生的蛋白質超二級結構Motif類型
4.4超二級結構的結構特征描述
4.5簡單的超二級結構Motif折疊組合成復雜超二級結構Motif
參考文獻
第5章復雜超二級結構Motif與折疊子類(Folds)
5.1復雜超二級結構Motif折疊組合高級結構
5.2折疊子類
5.3折疊子與結構類型
參考文獻
第6章蛋白質的三級結構與結構域
6.1蛋白質的三級結構
6.2結構域
6.3球狀蛋白質和結構域的解剖學
6.4蛋白質(結構域)立體結構的比較
參考文獻
第7章蛋白質的四級結構和蛋白質體系
7.1蛋白質的四級結構
7.2蛋白質體系
參考文獻
第8章蛋白質晶體結構分析
8.1晶體結構分析簡介
8.2蛋白質晶體學簡介
8.3蛋白質晶體生長
8.4數(shù)據(jù)收集和處理
8.5同晶置換法
8.6分子置換法
8.7同晶差值傅里葉法
8.8電子密度圖的計算和解釋
8.9結構精修
參考文獻
第9章多維核磁共振技術
9.1多維核磁共振方法確定蛋白質溶液三維結構的基本原理
9.2提取蛋白質結構信息的多維核磁共振方法
9.3蛋白質溶液三維結構的計算
參考文獻
第10章蛋白質溶液構象的光譜技術
10.1紫外-可見差光譜
10.2熒光探針法
10.3圓二色譜..
10.4激光拉曼光譜
10.5紅外光譜在研究蛋白質二級結構中的應用
參考文獻
第11章蛋白質的二維結晶及結構重建
11.1蛋白質晶體的類型
11.2蛋白質的二維結晶化
11.3膜蛋白二維晶體形成的機制與條件
11.4電鏡觀察與三維結構重建
參考文獻
第12章蛋白質結構的計算機圖象分析與分子模擬技術
12.1計算機圖形學
12.2圖形顯示設備
12.3圖形系統(tǒng)和工作站
12.4生物大分子的分子模擬與計算機圖形技術
參考文獻
第13章蛋白質結構預測
13.1蛋白質結構預測概述
13.2正誤構象的判斷
13.3現(xiàn)階段幾種主要的簡單評估函數(shù)方法
13.4基于知識的蛋白質結構預測.
13.5蛋白質的二級結構預測
13.6利用計算機互聯(lián)網(wǎng)進行蛋白質結構預測
參考文獻
第14章蛋白質結構研究中的幾種數(shù)理方法
14.1遺傳算法
14.2人工神經網(wǎng)絡方法
14.3統(tǒng)計物理學方法
14.4一些數(shù)理方法算法的進一步討論
參考文獻
第15章蛋白質分子動力學
15.1分子動力學模擬方法
15.2經驗力場和位能函數(shù)
15.3能量優(yōu)化
15.4自由能計算
15.5模擬退火技術
15.6環(huán)境效應
15.7簡振模分析
參考文獻
第16章蛋白質工程與藥物分子設計
16.1什么是蛋白質工程
16.2蛋白質工程領域的開創(chuàng)性工作
16.3蛋白質的改性及分子設計——當前蛋白質工程研究的熱點之一
16.4基于生物大分子結構的藥物設計——當前蛋白質工程
16.5蛋白質結構預測與藥物分子設計
16.6尚待解決的問題和充滿希望的前景
參考文獻
第17章蛋白質的分子進化
17.1分子進化鐘與中性理論
17.2功能相關的分子進化與非中性分子進化
參考文獻
第18章酶分子的結構與功能
18.1酶分子的結構特點
18.2酶催化作用特點
18.3酶的分類和命名法
18.4酶的抑制作用
18.5調節(jié)酶
18.6羧肽酶A的催化功能和分子結構
18.7多酶復合物
參考文獻
第19章蛋白質的分子運動
19.1蛋白質的結構生物學
19.2蛋白質分子的運動
19.3展望.
參考文獻
第20章電子傳遞蛋白的結構與功能
20.1細胞色素c
20.2鐵硫蛋白
20.3藍色銅蛋白
20.4黃素氧還蛋白
參考文獻...
附錄用傅里葉變換方法進行三維重構的一般原理