小分子探針與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)

目錄
前言
第一篇 用于細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程研究的分子探針
第1章 基于天然產(chǎn)物化學(xué)合成的細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)探針 3
1.1 引言 3
1.2 研究進(jìn)展與成果 4
1.2.1 天然產(chǎn)物分子探針引導(dǎo)的化學(xué)生物學(xué)研究工作案例 6
1.2.2 功能導(dǎo)向的天然產(chǎn)物合成促進(jìn)藥物創(chuàng)新 9
1.2.3 天然產(chǎn)物生理活性機(jī)制研究促生新機(jī)制和新概念 13
1.3 討論與展望 15
1.3.1 培植適宜于交叉融合研究的文化土壤 16
1.3.2 變革科學(xué)家知識(shí)結(jié)構(gòu)和教育方式 16
1.3.3 發(fā)掘具有中國(guó)特色和影響力的生理藥理活性天然產(chǎn)物研究素材 17
1.3.4 加強(qiáng)基礎(chǔ)教育訓(xùn)練和人才儲(chǔ)備 17
參考文獻(xiàn) 18
第2章 靶向細(xì)胞自噬通路的小分子探針 21
2.1 引言 21
2.2 研究進(jìn)展與成果 24
2.2.1 自噬調(diào)控化合物篩選 24
2.2.2 MBCQ對(duì)自噬的抑制效應(yīng) 25
2.2.3 MBCQ構(gòu)效關(guān)系研究 30
2.2.4 MBCQ抑制自噬相關(guān)的細(xì)胞死亡 35
2.2.5 探究MBCQ抑制自噬的作用機(jī)理 35
2.2.6 MBCQ系列小分子抑制自噬的應(yīng)用研究 47
2.3 討論與展望 49
參考文獻(xiàn) 51
第3章 化學(xué)遺傳學(xué)與小分子庫(kù) 54
3.1 引言 54
3.2 研究進(jìn)展與成果 55
3.2.1 CypA簡(jiǎn)介 55
3.2.2 文獻(xiàn)報(bào)道的CypA配體（抑制劑和激動(dòng)劑） 56
3.2.3 一種創(chuàng)新的CypA配體（抑制劑）化合物庫(kù) 57
3.2.4 一種創(chuàng)新的CypA配體（激動(dòng)劑）化合物庫(kù) 60
3.2.5 CypA配體（激動(dòng)劑）作用位點(diǎn)和機(jī)制研究 62
3.2.6 CypA配體（抑制劑）介導(dǎo)的非小細(xì)胞肺癌新信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路 64
3.3 討論與展望 73
參考文獻(xiàn) 75
第4章 蛋白質(zhì)與多肽的化學(xué)合成 79
4.1 引言 79
4.2 研究進(jìn)展與成果 81
4.2.1 蛋白質(zhì)化學(xué)合成方法的發(fā)展 81
4.2.2 蛋白質(zhì)翻譯后修飾 88
4.2.3 蛋白多肽藥物 97
4.2.4 鏡像蛋白質(zhì) 102
4.3 討論與展望 106
參考文獻(xiàn) 110
第5章 核酸探針?lè)肿?117
5.1 引言 117
5.2 研究進(jìn)展與成果 119
5.2.1 核酸特殊表觀遺傳修飾的測(cè)定 119
5.2.2 高選擇性靶向四鏈核酸性的化學(xué)小分子設(shè)計(jì)篩選及調(diào)控 125
5.2.3 端粒相關(guān)蛋白相互作用 130
5.2.4 利用化學(xué)小分子和RNAi策略研究cADPR介導(dǎo)的鈣信號(hào)通路 134
5.3 討論與展望 139
參考文獻(xiàn) 140
第6章 聚糖分子探針的合成與應(yīng)用 143
6.1 引言 143
6.2 研究進(jìn)展與成果 144
6.2.1 聚糖的化學(xué)合成 144
6.2.2 聚糖探針的應(yīng)用 148
6.3 討論與展望 152
參考文獻(xiàn) 152
第7章 非天然氨基酸探針 154
7.1 引言 154
7.2 研究進(jìn)展與成果 157
7.2.1 基因編碼發(fā)展蛋白質(zhì)標(biāo)記新方法 158
7.2.2 基因編碼非天然氨基酸核磁探針 160
7.2.3 非天然氨基酸探針在病毒疫苗研究領(lǐng)域的應(yīng)用 163
7.2.4 非天然氨基酸探針用于抗體藥物偶聯(lián)物制備 170
7.2.5 基因編碼非天然氨基酸探針研究模擬金屬蛋白酶 177
7.3 討論與展望 187
參考文獻(xiàn) 190
第二篇 探測(cè)細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程的新技術(shù)和新方法
第8章 單分子檢測(cè) 195
8.1 引言 195
8.2 研究進(jìn)展與成果 197
8.2.1 單分子顯微成像系統(tǒng) 197
8.2.2 活細(xì)胞體系單分子熒光標(biāo)記新方法 201
8.2.3 高通量單分子定位和追蹤算法 203
8.2.4 蛋白激活和轉(zhuǎn)運(yùn)的新模式與新機(jī)制 205
8.3 討論與展望 219
8.3.1 發(fā)展具有更高特異性和光學(xué)穩(wěn)定性的熒光探針及內(nèi)源蛋白標(biāo)記方法 219
8.3.2 發(fā)展兼具高空間和時(shí)間分辨率的超分辨顯微成像技術(shù) 220
8.3.3 發(fā)展細(xì)胞內(nèi)和活體組織的3D單分子熒光成像方法 220
8.3.4 發(fā)展更加精確可靠的單分子數(shù)據(jù)分析方法 221
8.3.5 發(fā)展光學(xué)成像與譜學(xué)相結(jié)合的方法 221
參考文獻(xiàn) 222
第9章 單細(xì)胞分析 226
9.1 引言 226
9.2 研究進(jìn)展與成果 229
9.2.1 基于小分子探針的單細(xì)胞成像技術(shù) 229
9.2.2 微流控芯片輔助的單細(xì)胞分析技術(shù) 235
9.2.3 基于小分子探針的流式細(xì)胞分析技術(shù) 239
9.2.4 借助電化學(xué)技術(shù)的單細(xì)胞分析方法 242
9.3 討論與展望 244
參考文獻(xiàn) 246
第10章 基因組測(cè)序與分析 251
10.1 引言 251
10.2 研究進(jìn)展與成果 254
10.2.1 基于微流控芯片的單細(xì)胞全基因組異質(zhì)性研究 255
10.2.2 基于微流控芯片的單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性研究 258
10.2.3 針對(duì)微量細(xì)胞樣品的染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序技術(shù)的研發(fā) 259
10.2.4 單細(xì)胞環(huán)形RNA與線性RNA的同時(shí)檢測(cè)技術(shù)的研發(fā) 261
10.3 討論與展望 263
參考文獻(xiàn) 268
第11章 化學(xué)分子介導(dǎo)的蛋白質(zhì)靶向降解 271
11.1 引言 271
11.1.1 通過(guò)降低細(xì)胞內(nèi)目標(biāo)蛋白的含量抑制蛋白質(zhì)活性 271
11.1.2 化學(xué)分子介導(dǎo)蛋白質(zhì)的靶向降解策略簡(jiǎn)介 271
11.1.3 化學(xué)分子介導(dǎo)蛋白質(zhì)的靶向降解策略研究進(jìn)展 273
11.2 研究進(jìn)展與成果 275
11.2.1 神經(jīng)退行性疾病及相關(guān)重要病理蛋白 275
11.2.2 化學(xué)分子介導(dǎo)Tau蛋白的靶向降解 275
11.2.3 化學(xué)分子介導(dǎo)TDP-43蛋白的靶向降解 291
11.3 討論與展望 296
參考文獻(xiàn) 299
第12章 金屬離子探針與檢測(cè) 301
12.1 引言 301
12.2 研究進(jìn)展與成果 302
12.2.1 化學(xué)小分子類(lèi)金屬離子探針的開(kāi)發(fā) 302
12.2.2 基于核酸的金屬離子探針的開(kāi)發(fā) 312
12.2.3 基于納米材料的金屬離子探針的開(kāi)發(fā) 313
12.2.4 蛋白質(zhì)水平的金屬離子探針的開(kāi)發(fā) 313
12.2.5 全細(xì)胞水平的金屬離子探針的開(kāi)發(fā) 315
12.3 討論與展望 323
參考文獻(xiàn) 324
第13章 熒光傳感與光調(diào)控 329
13.1 引言 329
13.2 研究進(jìn)展與成果 331
13.2.1 監(jiān)測(cè)細(xì)胞代謝的遺傳編碼熒光探針 331
13.2.2 大分子光開(kāi)關(guān) 337
13.2.3 基于光誘導(dǎo)成鍵反應(yīng)的化學(xué)探針及光調(diào)控開(kāi)關(guān) 341
13.3 討論與展望 347
13.3.1 光化學(xué)生物學(xué)的前沿研究方向和挑戰(zhàn) 347
13.3.2 光遺傳學(xué)的前沿研究方向和挑戰(zhàn) 349
13.3.3 遺傳編碼熒光探針的前沿研究方向和挑戰(zhàn) 350
參考文獻(xiàn) 351
第14章 熒光蛋白與超分辨成像 356
14.1 引言 356
14.2 研究進(jìn)展與成果 358
14.2.1 單體光轉(zhuǎn)換熒光蛋白的開(kāi)發(fā) 358
14.2.2 光開(kāi)關(guān)熒光蛋白的開(kāi)發(fā)與應(yīng)用 360
14.2.3 新型超分辨成像技術(shù)—SIMBA 368
14.2.4 冷凍光電關(guān)聯(lián)成像 369
14.3 討論與展望 371
參考文獻(xiàn) 374
第三篇 基于化學(xué)探針的細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究
第15章 白血病細(xì)胞分化的分子機(jī)制與小分子干預(yù) 379
15.1 引言 379
15.1.1 白血病與化學(xué)生物學(xué) 379
15.1.2 天然產(chǎn)物與白血病化學(xué)生物學(xué) 381
15.2 研究進(jìn)展與成果 383
15.2.1 腺花素誘導(dǎo)AML細(xì)胞分化 383
15.2.2 腺花素的構(gòu)效關(guān)系和分子探針的合成 385
15.2.3 腺花素靶向過(guò)氧化物還原酶Ⅰ/Ⅱ 386
15.2.4 Prdx Ⅰ/Ⅱ是腺花素誘導(dǎo)白血病細(xì)胞分化的有效靶標(biāo) 388
15.2.5 腺花素靶向Prdx Ⅰ/Ⅱ誘導(dǎo)白血病細(xì)胞分化的信號(hào)機(jī)制 389
15.3 討論與展望 390
15.3.1 ent-Jungermannenone C以與腺花素相似的機(jī)制誘導(dǎo)AML細(xì)胞分化 391
15.3.2 以Prdx Ⅰ為靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)新的誘導(dǎo)AML細(xì)胞分化的新化合物 391
15.3.3 腺花素靶向Prdx Ⅰ/Ⅱ的抗腫瘤效應(yīng)的拓展 392
參考文獻(xiàn) 393
第16章 細(xì)胞可塑性的調(diào)控機(jī)制研究 395
16.1 引言 395
16.2 研究進(jìn)展與成果 397
16.2.1 細(xì)胞有絲分裂的化學(xué)生物學(xué)研究 397
16.2.2 細(xì)胞命運(yùn)抉擇可塑性的化學(xué)生物學(xué)研究 403
16.3 討論與展望 405
參考文獻(xiàn) 407
第17章 靶向Wnt信號(hào)通路的小分子調(diào)節(jié)劑 410
17.1 引言 410
17.2 研究進(jìn)展與成果 412
17.2.1 NC043 412
17.2.2 HLY78 429
17.3 討論與展望 435
參考文獻(xiàn) 437
第18章 細(xì)胞的糖脂代謝 439
18.1 引言 439
18.1.1 膽固醇代謝平衡的調(diào)控 439
18.1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激與糖脂代謝平衡 440
18.2 研究進(jìn)展與成果 441
18.2.1 揭示膽固醇代謝過(guò)程的調(diào)控機(jī)制 442
18.2.2 揭示IRE1α通路在糖脂代謝調(diào)控中的作用機(jī)制 444
18.2.3 系列成果：溶酶體與過(guò)氧化物酶體形成膜接觸介導(dǎo)膽固醇轉(zhuǎn)運(yùn) 446
18.2.4 系列成果：新的膽固醇修飾蛋白篩選鑒定及功能 454
18.2.5 系列成果：SCAP-SREBP途徑特異性抑制劑的發(fā)現(xiàn)及其機(jī)理與功能研究 462
18.3 討論與展望 483
18.3.1 溶酶體與過(guò)氧化物酶體形成膜接觸介導(dǎo)膽固醇轉(zhuǎn)運(yùn) 484
18.3.2 膽固醇修飾SMO的調(diào)控及功能模型 485
18.3.3 白樺酯醇是SREBP途徑的特異性抑制劑 485
18.3.4 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激IRE1α通路：代謝紊亂的干預(yù)靶標(biāo) 487
參考文獻(xiàn) 487
第19章 核酸及其修飾物介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究 489
19.1 引言 489
19.2 研究進(jìn)展與成果 494
19.2.1 DNA中胞嘧啶衍生物的檢測(cè)技術(shù) 495
19.2.2 RNA修飾檢測(cè)技術(shù) 497
19.2.3 生物調(diào)控功能（寡或環(huán)）核苷酸的修飾研究 499
19.3 討論與展望 501
參考文獻(xiàn) 502
第20章 靶向細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的天然產(chǎn)物生物合成路徑與機(jī)制 507
20.1 引言 507
20.2 研究進(jìn)展與成果 508
20.2.1 以硫醇化學(xué)為核心的林可酰胺類(lèi)抗生素的生物合成機(jī)制研究 508
20.2.2 螺環(huán)乙酰乙酸內(nèi)酯/內(nèi)酰胺類(lèi)抗生素骨架構(gòu)筑的生化機(jī)制研究 514
20.2.3 硫肽類(lèi)抗生素的生物合成機(jī)制和作用機(jī)制研究