梅花基因組學(xué)研究（精）

前言
第1章 梅花全基因組測序及精細(xì)圖譜構(gòu)建
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 梅花基因組測序策略與原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
2．2 K-mer分析估算梅花基因組大小
2．3 梅花基因組初步組裝
2．4 基因組GC含量分析
2．5 WGM數(shù)據(jù)輔助基因組組裝
2．6 錨定基因組組裝序列
2．7 梅花不同器官轉(zhuǎn)錄組測序
2．8 梅花全基因組注釋
2．9 梅花基因組進(jìn)化分析
2．10 薔薇科祖先染色體構(gòu)建
2．11 梅花花香機(jī)制研究
2．12 梅花低溫開花機(jī)制研究
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附表 部分植物基因組測序
第2章 梅花重要品種重測序與全基因組關(guān)聯(lián)分析
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 梅花基因組重測序和遺傳變異挖掘
2．2 梅花群體遺傳學(xué)分析
2．3 杏和李的基因滲入
2．4 梅花和李屬近緣物種的泛基因組分析
2．5 梅花10個(gè)觀賞性狀的GWAS分析
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第3章 梅花遺傳圖譜構(gòu)建與重要性狀QTL定位
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 梅花遺傳作圖群體構(gòu)建
2．2 梅花遺傳框架圖譜構(gòu)建
2．3 梅花高密度遺傳圖譜構(gòu)建與生長性狀的QTL定位
2．4 梅花基因組與李屬參考圖間共線性分析
2．5 梅花高密度遺傳圖譜及垂枝性狀QTL定位
2．6 梅花重要性狀定位分析
2．7 梅花垂枝性狀精細(xì)定位及候選基因篩選
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第4章 梅花花香分子機(jī)理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 李屬花香揮發(fā)物成分與遺傳變異分析
2．2 杏梅和櫻李梅特征花香缺失分析
2．3 梅花花香主要揮發(fā)性成分時(shí)空揮發(fā)模式
2．4 ‘三輪玉碟’不同開花時(shí)期比較轉(zhuǎn)錄組測序分析
2．5 梅花盛花期不同花器官基因表達(dá)模式分析
2．6 梅花‘三輪玉碟’花全長轉(zhuǎn)錄本測序
2．7 梅花花香調(diào)控MYB基因克隆與功能分析
2．8 梅花BAHD家族基因克隆與功能驗(yàn)證
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第5章 梅花花發(fā)育分子機(jī)理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 梅花花發(fā)育sRNA轉(zhuǎn)錄組及miRNA表達(dá)分析
2．2 梅花休眠相關(guān)DELLA基因克隆與功能分析
2．3 梅花花器官發(fā)育相關(guān)MADS-box基因功能分析
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第6章 梅花花色分子機(jī)理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 梅花花色表型測定
2．2 梅花花青素苷成分鑒定
2．3 梅花花青素苷定量分析
2．4 梅花花青素苷組成與花色參數(shù)關(guān)系分析
2．5 梅花R2R3-MYB基因家族分析
2．6 梅花R2R3-MYB基因功能分析
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第7章 梅花抗寒分子機(jī)理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結(jié)果
2．1 梅花PmICE1基因功能分析
2．2 梅花PmLEA基因功能分析
2．3 梅花PmDAM和PmCBF基因功能分析
3 結(jié)論
參考文獻(xiàn)