晶體和準(zhǔn)晶體的衍射（第2版）

第1章  晶體衍射研究的發(fā)展
1.1  早期的工作
1.2  無機(jī)物晶體結(jié)構(gòu)的發(fā)展
1.3  有機(jī)物晶體結(jié)構(gòu)的發(fā)展
1.4  生物大分子晶體結(jié)構(gòu)的發(fā)展
1.5  現(xiàn)狀和展望
參考文獻(xiàn)
第2章  晶體結(jié)構(gòu)的對稱性
2.1  晶體的點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)和晶胞
2.2  晶體結(jié)構(gòu)的對稱元素
2.3  晶系、晶族和空間點(diǎn)陣型式
2.3.1  晶系和晶族
2.3.2  晶體的空間點(diǎn)陣型式
2.4  晶體學(xué)點(diǎn)群
2.4.1  點(diǎn)群的推引
2.4.2  點(diǎn)群的國際記號和對稱元素的取向
2.4.3  晶體學(xué)點(diǎn)群的對稱性和晶體的物理性質(zhì)
2.5  晶體學(xué)空間群
2.5.1  空間群的推引
2.5.2  空間群記號
2.5.3  等效點(diǎn)系、不對稱單位和結(jié)構(gòu)基元
2.5.4  平面群
參考文獻(xiàn)
第3章  晶體的衍射方向和倒易點(diǎn)陣
3.1  X射線的性質(zhì)
3.2  Laue方程
3.3  Bragg方程
3.4  倒易點(diǎn)陣
3.4.1  倒易點(diǎn)陣的定義
3.4.2  倒易點(diǎn)陣的性質(zhì)
3.4.3  關(guān)于復(fù)晶胞的變換
3.5  反射球（Ewald球）
3.6  單晶體衍射數(shù)據(jù)收集方法
3.6.1  簡介
3.6.2  四圓衍射儀法
3.6.3  面探測器法
參考文獻(xiàn)
第4章  衍射強(qiáng)度和結(jié)構(gòu)因子
4.1  衍射法測定晶體結(jié)構(gòu)的一般步驟
4.2  晶體衍射的一些概念和方法
4.2.1  倒易空間和晶體空間
4.2.2  衍射波的數(shù)學(xué)表示
4.2.3  晶體空間和倒易空間的傅里葉變換
4.3  晶胞對X射線的散射
4.3.1  電子的散射
4.3.2  原子的散射
4.3.3  晶胞的散射
4.4  晶體的衍射強(qiáng)度
4.4.1  一小粒完美晶體對X射線的衍射
4.4.2  鑲嵌晶體的衍射強(qiáng)度
4.5  影響衍射強(qiáng)度的各種因子
4.5.1  偏極化因子和角速度因子
4.5.2  溫度因子
4.5.3  吸收因子
4.5.4  消光
4.5.5  多重度因子
4.6  衍射強(qiáng)度的修正和還原
4.7  系統(tǒng)消光和空間群的確定
4.8  結(jié)構(gòu)因子
4.8.1  結(jié)構(gòu)因子的含義和表達(dá)
4.8.2  結(jié)構(gòu)因子的電子密度函數(shù)表達(dá)式
4.8.3  單位結(jié)構(gòu)因子
4.8.4  歸一結(jié)構(gòu)因子
參考文獻(xiàn)
第5章  電子密度函數(shù)的計(jì)算和精修
5.1  電子密度函數(shù)表達(dá)式
5.1.1  電子密度函數(shù)表達(dá)式的推引
5.1.2  推引相角的方法
5.2  直接法
5.2.1  歸一結(jié)構(gòu)因子的若干統(tǒng)計(jì)規(guī)律
5.2.2  結(jié)構(gòu)不變量和結(jié)構(gòu)半不變量
5.2.3  Sayre公式
5.2.4  E圖的應(yīng)用
5.3  Patterson函數(shù)法
5.3.1  Patterson函數(shù)
5.3.2  Harker截面
5.3.3  重原子法
5.3.4  分子置換法簡介
5.4  同晶置換法簡介
5.5  反常散射法
5.5.1  手性及絕對構(gòu)型
5.5.2  反常散射效應(yīng)
5.5.3  分子絕對構(gòu)型測定的方法和實(shí)例
5.6  晶體結(jié)構(gòu)的精修
5.6.1  電子密度圖的應(yīng)用
5.6.2  ρo，ρc和ρE
5.6.3  差值電子密度圖
5.6.4  變形電子密度圖（X?N圖和X?X圖）
參考文獻(xiàn)
第6章  生物大分子晶體衍射
6.1  引言
6.2  生物大分子晶體制備
6.2.1  生物大分子晶體的特性
6.2.2  生物大分子樣品的提取和純化
6.2.3  生物大分子結(jié)晶過程的獨(dú)特性和影響因素
6.2.4  生物大分子晶體制備的實(shí)驗(yàn)技術(shù)
6.2.5  晶體的表征和獲得合用晶體的方法
6.2.6  重原子衍生物的制備
6.3  生物大分子晶體衍射數(shù)據(jù)的收集
6.3.1  X射線源和探測器
6.3.2  回?cái)[法收集生物大分子晶體衍射數(shù)據(jù)
6.3.3  數(shù)據(jù)處理
6.3.4  反常散射數(shù)據(jù)的收集
6.3.5  晶體的衰減和晶體的冷凍技術(shù)
6.3.6  衍射數(shù)據(jù)分辨率
6.3.7  衍射數(shù)據(jù)的評估
6.4  相角測定法
6.4.1  同晶型置換法
6.4.2  分子置換法（MR）
6.4.3  多波長反常散射法（MAD）
6.4.4  電子密度調(diào)整和相角組合方法改進(jìn)相角
6.5  電子密度圖的計(jì)算
6.5.1  電子密度圖的類型
6.5.2  差值電子密度圖的應(yīng)用
6.5.3  電子密度圖詮釋
6.5.4  結(jié)構(gòu)模型的搭建
6.6  晶體結(jié)構(gòu)模型的修正
6.6.1  引論
6.6.2  傳統(tǒng)的最小二乘（LS）修正
6.6.3  非最小二乘修正的一些特殊方法
6.6.4  晶體結(jié)構(gòu)測定結(jié)果質(zhì)量的評價(jià)和量度
6.6.5  晶體結(jié)構(gòu)模型的表述
第6章附錄
附錄6.1  生物大分子結(jié)構(gòu)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫介紹
附錄6.2  關(guān)于R因子
參考文獻(xiàn)
第7章  多晶衍射
7.1  多晶X射線衍射方法
7.1.1  照相法
7.1.2  多晶X射線衍射儀的一般原理
7.1.3  測角儀的調(diào)整與衍射實(shí)驗(yàn)
7.2  多晶X射線衍射的積分強(qiáng)度
7.3  X射線衍射物相定性分析
7.3.1  物相定性分析的基本原理
7.3.2  標(biāo)準(zhǔn)衍射卡片及其檢索
7.3.3  物相分析：  實(shí)驗(yàn)與判斷
7.3.4  數(shù)字化的PDF
7.4  X射線衍射物相定量分析
7.4.1  多相體系的強(qiáng)度公式
7.4.2  相定量分析基本方法和原理
7.4.3  物相定量分析實(shí)驗(yàn)方法
7.5  衍射圖的指標(biāo)化
7.5.1  立方晶系指標(biāo)化方法：  解析法
7.5.2  Hesse?Lipson（赫西?利普森）解析法
7.5.3  常見指標(biāo)化程序原理和方法
7.5.4  指標(biāo)化結(jié)果的判斷
7.6  平均晶粒度的X射線測定
7.6.1  Scherrer方程：  物理意義與數(shù)學(xué)表達(dá)
7.6.2  衍射峰分析
7.6.3  β值的確定：  Kα雙線分離與儀器因素的處理
7.6.4  Scherrer公式的應(yīng)用
7.7  多晶X射線衍射結(jié)構(gòu)分析的重要方法--Rietveld法
7.7.1  Rietveld方法的基本原理
7.7.2  Rietveld方法的應(yīng)用（1）：  峰形擬合
7.7.3  Rietveld方法的應(yīng)用（2）：  結(jié)構(gòu)精修、完善與相定量
7.8  中子衍射
7.8.1  中子的基本性質(zhì)、產(chǎn)生與探測
7.8.2  物質(zhì)對中子的散射：  散射長度
7.8.3  中子衍射晶體結(jié)構(gòu)分析
7.8.4  中子衍射磁結(jié)構(gòu)分析
參考文獻(xiàn)
第8章  晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的應(yīng)用
8.1  晶胞參數(shù)的應(yīng)用
8.2  分子的幾何構(gòu)型
8.2.1  鍵長和鍵角的計(jì)算
8.2.2  分子幾何構(gòu)型測定實(shí)例
8.2.3  鍵長和原子半徑
8.3  分子的構(gòu)象
8.3.1  構(gòu)型和構(gòu)象
8.3.2  構(gòu)象的表示
8.3.3  多肽鏈的構(gòu)象
8.3.4  天花粉蛋白的結(jié)構(gòu)與功能的研究
8.4  化學(xué)鍵的類型和性質(zhì)
8.4.1  化學(xué)鍵的本質(zhì)及其多樣性
8.4.2  變形電子密度圖在化學(xué)鍵研究中的應(yīng)用
8.5  晶體中分子和離子的堆積
8.5.1  冰的結(jié)構(gòu)
8.5.2  鈣鈦礦（CaTiO3）的結(jié)構(gòu)
8.5.3  若干水合包合物的結(jié)構(gòu)
8.6  晶體中原子的運(yùn)動
8.6.1  晶體中原子的熱運(yùn)動
8.6.2  晶體中進(jìn)行的聚合反應(yīng)
8.6.3  晶體中進(jìn)行的消旋反應(yīng)
8.7  鍵價(jià)理論：  由原子間的鍵長計(jì)算原子的鍵價(jià)
8.7.1  鍵價(jià)理論的要點(diǎn)
8.7.2  鍵價(jià)理論在晶體結(jié)構(gòu)分析中的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
第9章  準(zhǔn)晶體
9.1  二十面體
9.1.1  二十面體對稱
9.1.2  二十面體密堆
9.1.3  二十面體骨架
9.2  三維準(zhǔn)晶
9.2.1  Al-Mn等二十面體準(zhǔn)晶
9.2.2  Ti-Ni等二十面體準(zhǔn)晶
9.2.3  穩(wěn)定的二十面體準(zhǔn)晶
9.3  二維準(zhǔn)晶
9.3.1  十重準(zhǔn)晶
9.3.2  八重準(zhǔn)晶
9.3.3  十二重準(zhǔn)晶
9.4  一維準(zhǔn)晶
第9章附錄  電子衍射與成像
參考文獻(xiàn)
第10章  準(zhǔn)點(diǎn)陣及衍射
10.1  一維準(zhǔn)點(diǎn)陣
10.1.1  Fibonacci數(shù)列
10.1.2    數(shù)列
10.1.3  二維空間投影
10.1.4  高維空間切割
10.2  二維準(zhǔn)點(diǎn)陣
10.2.1  Penrose圖
10.2.2  八重拼圖
10.2.3  八重準(zhǔn)點(diǎn)陣
10.2.4  五重、十重準(zhǔn)點(diǎn)陣
10.3  三維準(zhǔn)點(diǎn)陣
10.4  準(zhǔn)點(diǎn)陣的缺陷及衍射
參考文獻(xiàn)
第11章  準(zhǔn)晶體結(jié)構(gòu)測定法
11.1  準(zhǔn)晶的結(jié)構(gòu)模型
11.1.1  三維結(jié)構(gòu)模型
11.1.2  六維結(jié)構(gòu)模型
11.2  十重準(zhǔn)晶的結(jié)構(gòu)測定
11.2.1  十重準(zhǔn)晶的五維超點(diǎn)陣
11.2.2  Patterson函數(shù)
11.2.3  Al65Co15Cu20十重準(zhǔn)晶的結(jié)構(gòu)
11.3  二十面體準(zhǔn)晶的結(jié)構(gòu)測定
11.3.1  二十面體準(zhǔn)晶的六維超點(diǎn)陣
11.3.2  中子衍射
11.3.3  Al70Pd21Mn9二十面體準(zhǔn)晶的結(jié)構(gòu)
參考文獻(xiàn)
附錄1  五重旋轉(zhuǎn)對稱和二十面體準(zhǔn)晶體的發(fā)現(xiàn)
附錄2  準(zhǔn)晶與電子顯微學(xué)
索引