前言
目錄
1. 核酸結構的研究方法
1.1 導言
1.2 用于結構分析的X-光衍射法
1.2.1 概況
1.2.2 纖維衍射法
1.2.3 單晶法
1.3 研究核酸結構與動力學的核磁共振(NMR)法
1.4 核酸的分子建模與模擬
1.5 結構與動力學的化學、酶學和生物物理探針
1.6 結構數據源
1.7 核酸分子結構的可視化
1.7.1 本書中的結構
2. DNA和.RNA的組成
2.1 導言
2.2 堿基配對
2.3 堿基和堿基對的柔性
2.4 糖折疊
2.5 糖苷鍵的構象
2.6 骨架的扭轉角和相關柔性
3. 纖維和晶體中觀察到的DNA結構
3.1 結構的基本原理
3.1.1 螺旋的參數
3.1.2 堿基對的形態(tài)學特征
3.2 纖維衍射研究所得到的多聚核苷酸結構
3.2.1 經典的DNA結構
3.2.2 纖維中DNA的多態(tài)性
3.3 晶體結構分析所看到的B-DNA寡聚核苷酸結構
3.3.1 Dickerson-Drew十二聚
3.3.2 Dickerson-Drew十二聚的其他研究
3.3.3 其他B-DNA寡聚核苷酸的結構
3.3.4 B-DNA依賴于序列的特征:事例與預測
3.4 A-DNA寡聚核苷酸的晶體結構
3.4.1 A型八核苷酸
3.4.2 溶液中存在A型寡聚核苷酸嗎?晶體堆積效應
3.4.3 晶體中A—B的轉變
3.5 Z-DNA左手DNA
3.5.1 Z-DNA六核苷酸晶體結構
3.5.2 大體的結構特征
3.5.3 Z-DNA螺旋
3.5.4 其他Z-DNA結構
3.5.5 Z-DNA的生物學問題
3.6 彎曲的DNA
3.6.1 溶液中的DNA周期
3.6.2 A-片段及其彎曲
3.6.3 顯示彎曲的結構
3.6.4 PolydA.dT結構
3.7 小結
4. DNA的非標準結構和高級結構:DNA-DNA識別
4.1 DNA中的錯配
4.1.1 般特征
4.1.2 嘌呤:嘌呤錯配
4.1.3 烷基化的錯配
4.2 DNA三鏈螺旋
4.2.1 導言
4.2.2 結構研究
4.2.3 反平行三鏈螺旋與非標準堿基配對
4.2.4 三鏈的應用
4.3 鳥嘌呤四鏈結構
4.3.1 導言
4.3.2 DNA四鏈結構的總體特征
4.3.3 簡單的四鏈結構
4.3.4 復雜的四鏈結構
4.3.5 i模體
4.4 DNA連接
4.4.1 Holliday連接結構
4.4.2 DNA酶的結構
4.5 非天然DNA的結構
6. RNA結構及其多樣性
7. 蛋白質-DNA識別的原理
索引