藥用微生物資源研究技術(shù)

第1章 現(xiàn)代藥用微生物資源研究的技術(shù)(緒論)
1．1基于培養(yǎng)水平的藥用微生物資源收集技術(shù)
1．2基于非培養(yǎng)水平的藥用微生物資源收集技術(shù)
1．3生物信息學(xué)、芯片技術(shù)在藥用微生物研發(fā)中的應(yīng)用
1．4微生物發(fā)酵產(chǎn)物的生物活性評價技術(shù)
1．5微生物天然產(chǎn)物的分離純化與鑒定技術(shù)
1．6小結(jié)
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第2章 微生物菌株的分離
2．1細(xì)菌的分離
2．2放線菌的分離
2．3真菌的分離
實(shí)驗(yàn)2．1紅樹林土壤中可培養(yǎng)細(xì)菌的分離
實(shí)驗(yàn)2．2紅樹林土壤中鏈霉菌的分離
實(shí)驗(yàn)2．3紅樹林土壤中稀有放線菌的分離
實(shí)驗(yàn)2．4紅樹林海洋真菌的分離
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第3章 微生物分類與鑒定
3．1形態(tài)特征
3．2生理生化特征
3．3分子生物學(xué)特征
實(shí)驗(yàn)3．1埋片法觀察放線菌個體形態(tài)特征
實(shí)驗(yàn)3．2載片培養(yǎng)法觀察霉菌個體形態(tài)特征
實(shí)驗(yàn)3．3 利用BIOLOG自動化鑒定系統(tǒng)測定微生物對碳源的利用
實(shí)驗(yàn)3．4 16S rRNA序列的獲得及分析
實(shí)驗(yàn)3．5 Tm法測定(G+C)mol％
實(shí)驗(yàn)3．6微孔板DNA雜交
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第4章 微生物菌種保藏
4．1斜面低溫保藏法
4．2干燥保藏法
4．3液氮超低溫保藏法
4．4蒸餾水保藏法
4．5甘油(或二甲基亞砜)保藏法
4．6小結(jié)
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第5章 環(huán)境樣品總DNA的提取與純化
5．1 DNA的提取
5．2 DNA的純化
5．3提取質(zhì)量的評價
5．4小結(jié)
5．5紅樹林土壤DNA的提取與純化的幾種方法
實(shí)驗(yàn)5．5．1 SDS—GITC—PEG法
實(shí)驗(yàn)5．5．2 SDS—GITC—FastPrep—PEG法
實(shí)驗(yàn)5．5．3 Nycodenz法
實(shí)驗(yàn)5．5．4 脈沖凝膠電泳(pulsed field gel electrophmesis，PFGE)膠回收法
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第6章 微生物的多樣性分析
6．1 總DNA分析
6．2核酸探針雜交分析技術(shù)
6．3基于PCR的多樣性分析技術(shù)
6．4 DNA序列分析
6．5組合應(yīng)用
實(shí)驗(yàn)6．1變性梯度凝膠電泳
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第7章 宏基因組技術(shù)
7．1 高質(zhì)量DNA的提取
7．2載體的選擇
7．3宿主的選擇
7．4宏基因組文庫的篩選
7．5宏基因組文庫基因序列的鑒定
7．6小結(jié)
實(shí)驗(yàn)7．1紅樹林土壤宏基因組文庫的構(gòu)建-
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第8章 生物芯片
8．1基因芯片
8．2蛋白芯片
8．3芯片實(shí)驗(yàn)室
實(shí)驗(yàn)8．1 構(gòu)建用于分析自然環(huán)境中硝化和反硝化細(xì)菌群落的功能基因芯片
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第9章 生物信息學(xué)
9．1微生物基因組研究
9．2微生物多樣性
9．3微生物天然產(chǎn)物合成相關(guān)功能基因注釋及預(yù)測
9．4新型抗生素的開發(fā)
9．5微生物的系統(tǒng)發(fā)育
9．6生物信息學(xué)應(yīng)用實(shí)例
實(shí)例9．1對一具有抗菌活性陽性克隆子中的插入片段的注釋
實(shí)例9．2利用16S rDNA序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
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第10章 微生物發(fā)酵技術(shù)
10．1概述
10．2微生物的發(fā)酵
10．3發(fā)酵技術(shù)基本操作
10．4發(fā)酵機(jī)制
10．5抗生素的發(fā)酵機(jī)制
10．6發(fā)酵罐操作實(shí)例簡介
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第11章 微生物天然產(chǎn)物的分離與純化
11．1 概述
11．2微生物天然產(chǎn)物的分離提取
11．3微生物天然產(chǎn)物的純化
實(shí)例11．1海洋細(xì)菌細(xì)胞毒活性代謝產(chǎn)物的分離純化
實(shí)例11．2海洋放線菌菌株N350抗腫瘤活性產(chǎn)物的分離純化
實(shí)例11．3海洋真菌泡盛酒曲霉細(xì)胞毒活性物質(zhì)的分離純化
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第12章 微生物天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)鑒定
12．1微生物天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)鑒定的策略
12．2微生物天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)鑒定方法
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第13章 生物活性評價
13．1抗細(xì)菌活性檢測與評價
13．2抗真菌活性檢測與評價
13．3抗腫瘤活性藥敏試驗(yàn)和活性評價
13．4小結(jié)
實(shí)驗(yàn)13．1液體培養(yǎng)基稀釋法抗細(xì)菌活性測定
實(shí)驗(yàn)13．2 抗白色念珠菌活性檢測
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