藥物分子設計

前言
第1章 緒論(1)
11藥物的基本屬性(1)
12藥物與機體的相互作用(3)
121藥劑相(4)
122藥代動力相(4)
123藥效相(5)
13新藥的研究與開發(fā)(5)
131新藥的研究階段(5)
132新藥的開發(fā)階段(9)
14藥物發(fā)展簡史(10)
141以天然產(chǎn)物為主的發(fā)現(xiàn)時期(10)
142以合成藥物為主的發(fā)展時期(11)
143藥物分子設計時期(13)
144后基因組時代的藥物分子設計(16)
15結語(18)
參考文獻(19)
第2章 藥物作用的基本原理和相關知識(20)
21藥物受體的相互作用(20)
211影響焓變的相互作用(21)
212影響熵變的藥物受體相互作用(23)
213藥物受體結合的熱力學(25)
22分子力學(25)
221力學效應(26)
222化學效應(28)
223原子類型(29)
23分子動力學(29)
24酶抑制劑(31)
241酶反應的特點(31)
242藥物抑制的靶酶(32)
243酶抑制劑的作用環(huán)節(jié)(36)
244酶抑制劑分類(38)
25作用于受體的藥物(43)
251受體的結構與分類(43)
252作用于受體靶標的藥物——受體調節(jié)劑(46)
253配體受體相互作用的動力學分析(48)
254受體結合實驗(49)
255藥物受體的相互作用(50)
26作用于離子通道的藥物(51)
261離子通道的基本特征(51)
262離子通道調節(jié)劑(52)
27核酸(52)
271核酸的基本結構(52)
272作用于核酸的藥物(53)
參考文獻(53)
第3章 分子的多樣性——先導物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化(55)
31分子的多樣性(55)
311分子多樣性的表示方法(55)
312藥物分子的結構多樣性的生物學基礎(57)
32天然生物活性物質——次級代謝產(chǎn)物(59)
321天然產(chǎn)物的防御和繁衍機制(59)
322次級代謝產(chǎn)物及其結構修飾(61)
33組合化學(73)
331組合化學的一般概念(73)
332組合化學原理(74)
333組合合成方法(75)
334以天然產(chǎn)物為模板合成化合物庫(80)
34組合生物合成(85)
341原理(85)
342聚酮(86)
343肽類(88)
344其他(90)
35組合生物催化(91)
351原理(91)
352天然產(chǎn)物庫(91)
353生物催化用于組合化學(95)
36虛擬篩選(97)
361基于受體結構設計組合庫(97)
362組合庫的設計(99)
363定向庫(101)
364基于知識的化合物庫(101)
37動態(tài)組合化學(106)
371一般原理(106)
372動態(tài)庫的構建(107)
373舉例(108)
38多組分反應(112)
381原理(112)
382多組分反應的特點和在合成上的優(yōu)勢(113)
383重要的多組分反應(115)
384多組分反應在新藥研究中的應用(117)
385發(fā)現(xiàn)新的多組分反應的策略(118)
參考文獻(121)
第4章 分子的互補性——先導物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化(128)
41分子識別與相互作用(128)
411靜電作用能(129)
412立體作用(131)
413疏水作用(132)
414蛋白質配體相互作用中的溶劑作用(133)
42藥物受體相互作用的基團貢獻(134)
421基團貢獻的加和性(134)
422平均結合能(135)
43藥物受體相互作用及其原理(135)
431鎖鑰學說(135)
432誘導契合學說(136)
433受體構象群的穩(wěn)定化——受體選擇模型(136)
44基于受體結構的分子設計(140)
441基本概念(140)
442基于數(shù)據(jù)庫搜尋的分子設計(147)
443全新藥物分子設計(160)
444基于受體結構的組合化學庫的設計(178)
45基于代謝產(chǎn)物的藥物分子設計(180)
451引言(180)
452細胞色素P450(182)
453化學結構與氧化代謝的關系(183)
454基于代謝活化的分子設計(184)
455前藥(186)
456利用載體分子內(nèi)反應的前藥(193)
457利用酶反應或特異性結合作用設計前藥(197)
458逆代謝藥物設計——軟藥(199)
46抗體藥物(209)
461結構互補性——抗體抗原的相互作用(209)
462單克隆抗體藥物(213)
463用作藥物轉釋載體的單克隆抗體(216)
464基于單克隆抗體結構的分子設計(219)
465抗體導向酶催化前藥療法(222)
47高分子藥物和高分子前藥(229)
471引言(229)
472聚乙二醇化(229)
473HPMA共聚物作骨架(233)
474可生物降解的聚天然氨基酸(235)
475部位特異性高分子藥物(235)
48基于片斷的先導化合物的發(fā)現(xiàn)(236)
481基本原理(236)
482基于片斷發(fā)現(xiàn)先導物的方法(237)
49手性藥物(246)
491一般概念(247)
492手性藥物的藥代動力學(251)
493手性藥物的藥效學(258)
參考文獻(261)
第5章 分子的相似性——先導物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化(276)
51分子的相似性(276)
511分子相似性的定義和內(nèi)容(276)
512藥物分子設計中的相似性原理和方法(277)
52同系物、不飽和性、合環(huán)和開環(huán)(279)
521同系物(279)
522不飽和鍵(284)
523合環(huán)與開環(huán)(287)
53生物電子等排(292)
531電子等排的一般概念(292)
532一價基團的電子等排體(293)
533二價基團的電子等排體(303)
534三價原子或基團的電子等排體(305)
535四取代原子的電子等排體(307)
536環(huán)與非環(huán)的電子等排體(308)
537Topliss決策法(311)
54過渡態(tài)類似物(315)
541原理(315)
542舉例(315)
55酶自殺性底物(325)
551氨己烯酸和加巴苦林(325)
552依氟鳥氨酸(326)
553克拉維酸和舒巴克坦(328)
554司來吉蘭(329)
555非那雄胺(330)
556谷胱甘肽S轉移酶抑制劑(331)
56肽模擬物(332)
561肽類化合物的結構特征(332)
562肽模擬物(336)
563構象限制(337)
564非肽結構的肽模擬物(364)
57藥效團(372)
571一般概念(372)
572藥效團的表達方法(373)
573基于受體結合特征確定藥效團——神經(jīng)氨酸酶抑制劑(383)
58優(yōu)勢結構(384)
581基本概念(384)
582優(yōu)勢結構的特征(385)
583內(nèi)源性物質的優(yōu)勢結構(390)
59基于配體分子的藥物設計(405)
591組胺H2受體拮抗劑(405)
5925羥色胺受體調節(jié)劑(406)
593Ⅱb/Ⅲa糖蛋白受體拮抗劑(407)
594白三烯受體拮抗劑(409)
595P物質拮抗劑(410)
596維甲類化合物(411)
597甲氨蝶呤(413)
510攣藥(414)
5101同攣藥物(414)
5102異攣藥物(415)
參考文獻(417)
第6章 分子的相似性和互補性交匯——定量構效關系(436)
61二維定量構效關系(437)
611二維定量構效關系的基本原理(438)
612生物活性表示法(438)
62二維定量構效關系模型——Hansch藤田超熱力學分析(439)
621線性自由能相關參數(shù)(440)
622首批化合物的合成和Hansch藤田分析的要點(458)
623Hansch藤田分析用于藥物分子設計的實例(460)
624比較定量構效關系(468)
63FreeWilson模型(470)
631經(jīng)典的FreeWilson模型(470)
632FujitaBan改良模型(475)
633FreeWilson模型與Hansch藤田方法的異同(477)
64分子連接性方法(477)
641原子的支化值——點價(478)
642分子連接性指數(shù)的計算(480)
643分子連接性指數(shù)的物理化學意義(483)
644分子連接性在QSAR分析中的應用(438)
645分子連接性指數(shù)與Hansch藤田分析的關系(484)
65三維定量構效關系(484)
651三維定量構效關系的一般特征(485)
652三維定量構效關系分析法(491)
653舉例(498)
66全息定量構效關系(504)
661分子全息的生成(504)
662HQSAR模型表示法(505)
663舉例(505)
參考文獻(506)
第7章 藥物分子設計的整合性(510)
71新藥創(chuàng)制的價值鏈(510)
72結構優(yōu)化(511)
73分子設計策略的整合性(511)
731藥學性質的優(yōu)化(512)
732藥代動力學性質的優(yōu)化(513)
733藥效學性質的優(yōu)化(514)
734安全性評價(515)
735虛擬篩選(515)
74分子設計方法的整合性(516)
參考文獻(517)
附錄藥物化學名詞(519)
索引(526)
后記(539)