現(xiàn)代肝炎病毒分子生物學

     目錄
   第一章 肝炎病毒的分子生物學概論
    第一節(jié) 分子生物學的理論和技術是肝炎病毒研究的重要手段
    一、丙肝病毒和戊肝病毒的發(fā)現(xiàn)從基因水平上取得突破
    二、分子生物學技術是肝炎病毒病原學檢測的重要手段
    三、HBVDNA轉(zhuǎn)染細胞系的建立為HBV的研究提供了體外繁殖體系
    第二節(jié) 分子生物學技術是病毒性肝炎發(fā)病機制的研究手段
    一、分子雜交技術原位檢測肝炎病毒的核酸成分
    二、HBVDNA原位表達與HBcAg表達方式及其與病理改變的關系
    三、轉(zhuǎn)基因動物是研究HBV等肝炎病毒致病機制的合適的模型
    第三節(jié) 肝炎病毒的分子生物學研究可豐富分子生物學的理論
    一、HBVDNA復制是研究逆轉(zhuǎn)錄過程的一個很好的模型
    二、HBVDNA復制過程是研究轉(zhuǎn)錄物剪切加工機制的模型
    三、HBVDNA的研究也是基因表達調(diào)控的一個重要手段
    第四節(jié) 用分子生物學技術探索抗肝炎病毒治療的新途徑
    一、分泌抗病毒物質(zhì)的抗肝炎病毒基因治療
    二、利用肝炎病毒的反式調(diào)節(jié)機制探討抗肝炎病毒治療的新方法
    三、反義技術抗肝炎病毒治療方法
    第五節(jié) 肝炎病毒分子生物學內(nèi)容
    一、肝炎病毒的基因結(jié)構(gòu)和功能
    二、肝炎病毒基因表達和調(diào)控
    三、抗肝炎病毒新方法的探討
   第二章 甲型肝炎病毒的分子生物學
    第一節(jié) HAV基因結(jié)構(gòu)
    一、5′非翻譯區(qū)
    二、編碼區(qū)
    三、3′非翻譯區(qū)
    第二節(jié) HAV基因組編碼產(chǎn)物
    一、P1區(qū)
    二、P2區(qū)
    三、P3區(qū)
    第三節(jié) HAV的復制
    一、HAV體外增殖
    二、HAV在體內(nèi)的生活周期
    第四節(jié) HAV變異及分型
    一、HAV基因組核酸變異
    二、HAV氨基酸序列變異
    三、HAV分型
    第五節(jié) HAV抗原結(jié)構(gòu)
    第六節(jié) HAV減毒與細胞培養(yǎng)適應化的分子基礎
    一、HAV野毒株與減毒株核苷酸比較
    二、2B和2C區(qū)基因突變
    三、5′－NTR對HAV體外生長的影響
    第七節(jié) HAV疫苗的研究進展
    一、HAV滅活疫苗
    二、HAV減毒活疫苗
    三、基因工程疫苗
   第三章 乙肝病毒基因的結(jié)構(gòu)與功能
    第一節(jié) HBV基因組
    一、順向重復序列
    二、S基因區(qū)
    三、C基因區(qū)
    四、P基因區(qū)
    五、X基因區(qū)
    第二節(jié) HBV的復制
    一、HBV進入肝細胞
    二、HBV細胞內(nèi)移行
    三、超螺旋雙鏈HBVDNA的形成
    四、HBVDNA前基因組的合成與裝配
    五、HBVDNA雙鏈的形成
    六、HBV顆粒的裝配與釋放
    第三節(jié) HBVDNA的轉(zhuǎn)錄
    第四節(jié) HBV結(jié)構(gòu)蛋白
    一、包膜蛋白
    二、核心區(qū)蛋白
    三、HBVDNA多聚酶蛋白
    四、HBV的X蛋白
   第四章 丙肝病毒的分子生物學
    第一節(jié) HCV基因的克隆化
    一、HCV是一種RNA病毒
    二、5－1－1片段的克隆
    三、HCV基因組克隆化的意義
    第二節(jié) 丙肝病毒的基因結(jié)構(gòu)
    一、丙肝病毒基因的一級結(jié)構(gòu)
    二、中國河北株與美、日株一級結(jié)構(gòu)的比較
    三、中國丙型肝炎病毒河北流行株和上海流行株核苷酸序列的比較
    四、中國丙型肝炎病毒基因組克隆的方法
    第三節(jié) HCV基因組變異及分型
    一、HCV基因組分型的基礎
    二、HCV基因組分型的方法
    三、HCV基因組分型的意義
    第四節(jié) 丙肝病毒蛋白的翻譯
    一、HCV蛋白編碼的基因結(jié)構(gòu)
    二、核糖體與HCV5′－NTR結(jié)合的方式
    三、HCV病毒蛋白的裂解產(chǎn)物
    四、HCV病毒多蛋白的裂解酶NS3
    第五節(jié) 丙肝病毒感染的分子診斷
    一、HCV基因組擴增技術
    二、重組HCV抗原
    三、人工合成HCV抗原
    四、第一代抗－HCV檢測方法
    五、第二代抗－HCV檢測方法
    六、抗－HCVIgM的檢測
    七、HCV核酸和蛋白的原位表達
   第五章 丁型肝炎病毒的分子生物學
    第一節(jié) HDV的結(jié)構(gòu)特性
    第二節(jié) HDV的基因組和抗基因組
    一、HDV基因組的一級結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)
    二、HDV抗基因組RNA
    第三節(jié) HDV的復制
    一、研究HDV基因組復制的實驗系統(tǒng)
    二、HDVRNA復制的代謝需要
    三、亞基因組mRNA
    四、翻譯
    五、嗜肝DNA病毒在HDV基因組復制中的作用
    六、HDAg在HDV復制中的作用
    七、自身裂解
    八、自連
    九、HDV（復制）對HBV的影響
    第四節(jié) HDV的蛋白質(zhì)
    一、HDAg的一般特性
    二、兩種蛋白的結(jié)構(gòu)區(qū)及意義
    三、HDAg′的發(fā)現(xiàn)及特性
    四、28kDa的發(fā)現(xiàn)
    第五節(jié) HDV的分子生物學內(nèi)容在診斷、治療及預防等中的應用
    一、診斷上的應用
    二、治療上的應用
    三、預防上的應用
    四、其它的應用
   第六章 戊型肝炎病毒的分子生物學
    第一節(jié) HEV基因片段的克隆化
    一、原始材料
    二、HEVcDNA克隆化實驗流程
    三、HEVcDNA克隆的結(jié)果
    四、HEVcDNAET1.1成功的意義
    第二節(jié) HEV基因組的結(jié)構(gòu)
    一、HEV核苷酸的一級結(jié)構(gòu)
    二、HEVcDNA全序列克隆策略
    三、不同株的一級序列比較
    四、戊肝病毒基因組與其它肝炎病毒基因組的比較
    五、HEVRNA的二級結(jié)構(gòu)
    第三節(jié) HEV基因組表達研究
    一、HEVRNA開放讀框分析
    二、翻譯方式
    三、HEV抗原的表位
    第四節(jié) HEV基因重組表達與突變
    一、HEV蛋白在克隆載體中的表達
    二、HEV病毒蛋白融合基因的表達
    三、HEV基因組的變異與突變
    第五節(jié) HEV的生活周期與體外培養(yǎng)
    一、HEV的生活周期
    二、HEV的細胞培養(yǎng)
    第六節(jié) HEV的分子免疫學
    一、HEV病毒抗原
    二、HEV病毒蛋白的抗原決定簇
    三、HEV抗原在肝臟中的表達
    四、HEV表達人B細胞抗原表位
   第七章 庚型肝炎病毒和GB病毒的分子生物學
    一、概況
    二、GBVs和HGV的基因構(gòu)成及相應特性
    三、GBVs和HGV的結(jié)構(gòu)蛋白
   第八章 乙肝病毒DNA轉(zhuǎn)染細胞系的建立和應用
    第一節(jié) HBVDNA轉(zhuǎn)染細胞系的建立
    一、HBVDNA目的基因
    二、靶細胞的選擇
    三、基因轉(zhuǎn)移方法
    第二節(jié) HBVDNA轉(zhuǎn)染細胞系復制和表達的特點
    一、HBVDNA轉(zhuǎn)染細胞系中HBVDNA的存在狀態(tài)
    二、HBVDNA轉(zhuǎn)染細胞系中HBVDNA復制特點
    三、HBVDNA轉(zhuǎn)染細胞中的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物
    四、HBV蛋白的表達
    五、轉(zhuǎn)染細胞中HBVDNA表達調(diào)控
    六、HBV顆粒的裝配
    第三節(jié) 乙肝病毒基因組轉(zhuǎn)染細胞系的應用
    一、HBV結(jié)構(gòu)基因的表達
    二、HBVDNA調(diào)控研究
    三、HBVDNA突變研究
    四、HBV致病機制研究
    五、HBV感染與肝細胞癌的關系
    六、HBVDNA的轉(zhuǎn)染在HDV研究中的應用
    第四節(jié) 轉(zhuǎn)染細胞系在抗HBV藥物研究中的應用
    一、病毒基因組復制
    二、病毒的轉(zhuǎn)錄
    三、蛋白的表達
    四、藥物結(jié)構(gòu)和抗HBV活性關系
   第九章 乙肝病毒的基因突變研究
    第一節(jié) 人工突變研究方法
    一、直接的缺失與插入突變
    二、系列缺失突變體構(gòu)建
    三、人工合成方法
    四、PCR擴增法
    五、寡核苷酸定點誘變
    六、盒式突變
    第二節(jié) 直接重復序列的突變
    一、突變體的構(gòu)建
    二、DR區(qū)突變的意義
    第三節(jié) SORF基因突變
    一、前S1區(qū)突變
    二、前S2基因突變
    三、S基因突變
    第四節(jié) CORF區(qū)基因突變
    一、前C區(qū)突變
    二、C區(qū)突變
    第五節(jié) PORF和XORF的突變
    一、PORF的突變
    二、XORF的突變
   第十章 乙肝病毒復制和表達的調(diào)控
    第一節(jié) 基因調(diào)控的研究方法
    一、S1核酸酶作用
    二、引物延伸實驗
    三、基因突變法
    四、體外轉(zhuǎn)錄系統(tǒng)
    五、報道基因技術
    六、異種啟動子表達實驗
    七、尾隨序列的置換與突變
    第二節(jié) HBV基因調(diào)節(jié)的結(jié)構(gòu)基礎
    一、增強子序列
    二、HBV基因的啟動子
    第三節(jié) HBVDNA復制的調(diào)節(jié)
    一、HBVDNAP突變與HBVDNA復制
    二、前基因組RNA轉(zhuǎn)位與HBVDNA復制
    三、HDV基因共轉(zhuǎn)染對HBV復制的影響
    四、影響HBVDNA復制的細胞因子
    第四節(jié) HBVDNA轉(zhuǎn)錄物的剪切與調(diào)節(jié)
    一、HBVDNA轉(zhuǎn)錄物的種類和功能
    二、HBVDNA轉(zhuǎn)錄物剪切現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)
    三、HBVDNA轉(zhuǎn)錄物剪切機制
    四、HBVDNA轉(zhuǎn)錄物的剪切特點
   第十一章 乙肝病毒與細胞因子
    第一節(jié) 影響HBVDNA表達調(diào)控的細胞因子
    一、HBV感染的免疫應答
    二、細胞因子的應答
    三、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子的應答
    第二節(jié) 干擾素與乙肝病毒
    一、HBV感染導致IFN系統(tǒng)的改變
    二、干擾素對HBV復制與表達的影響
    三、HBVDNA的復制和表達對IFN的影響
    第三節(jié) 白細胞介素－2與乙肝病毒
    一、IL2抗病毒作用的發(fā)現(xiàn)
    二、ILL2的抗乙肝病毒作用
    三、IL－2抗HBV作用的機制
    四、IL－2轉(zhuǎn)基因表達抗病毒基因治療的優(yōu)勢
   第十二章 肝炎病毒與肝細胞癌
    第一節(jié) 肝炎病毒致肝細胞癌的證據(jù)
    一、病因?qū)W
    二、流行病學
    三、動物模型和轉(zhuǎn)基因動物
    四、轉(zhuǎn)染細胞的模型
    五、肝炎病毒與癌基因的激活
    第二節(jié) HBVDNA整合與HCC
    一、HBVDNA在肝細胞基因中的整合
    二、HBVDNA整合與HCC間的相互關系
    三、HBVDNA整合區(qū)的細胞基因重排
    四、乙型肝炎病毒致原發(fā)性肝癌模式
    第三節(jié) HBVDNAX基因與HCC
    一、X基因ORF的結(jié)構(gòu)和作用
    二、X抗原對癌基因的激活
    三、X基因研究的意義
    第四節(jié) 癌基因與HCC
    一、抗癌基因P53與肝細胞癌
    二、癌基因與肝細胞癌
    第五節(jié) HCV和HCC
    一、原發(fā)性肝癌的抗－］HCV檢測
   第十三章 乙肝病毒蛋白質(zhì)的基因工程表達
    第一節(jié) HBV蛋白基因工程表達的條件
    一、表達細胞宿主
    二、表達載體
    三、HBVDNA基因片段
    第二節(jié) 原核細胞表達系統(tǒng)
    第三節(jié) 酵母菌表達系統(tǒng)
    一、常用的酵母克隆載體
    二、啟動子的選擇
    第四節(jié) 哺乳動物細胞表達系統(tǒng)
    一、表達的策略
    二、小蛋白的表達
    三、中蛋白的表達
    四、大蛋白的表達
    第五節(jié) 非包膜蛋白的基因工程表達
    一、核心基因的表達
    二、多聚酶的表達及HBxAg的表達
   第十四章 乙肝病毒轉(zhuǎn)基因小鼠
    第一節(jié) 轉(zhuǎn)基因動物的發(fā)展
    一、早期的轉(zhuǎn)基因動物
    二、轉(zhuǎn)基因動物中基因的表達
    三、外源基因的表達對轉(zhuǎn)基因動物的影響
    第二節(jié) 轉(zhuǎn)基因動物的建立方法
    一、外源基因的準備
    二、生殖細胞的準備
    三、外源基因?qū)胧芫训姆椒?br />     四、受體動物的準備及轉(zhuǎn)導受精卵的植入
    五、轉(zhuǎn)基因動物的鑒定
    第三節(jié) 轉(zhuǎn)基因動物的應用
    一、腫瘤研究
    二、免疫學研究
    三、動物品種的改良
    四、基因表達的調(diào)節(jié)和控制
    五、生物工廠
    第四節(jié) 乙肝病毒轉(zhuǎn)基因小鼠
    一、乙肝病毒概況
    二、乙肝病毒轉(zhuǎn)基因小鼠的建立
    三、病毒基因表達的調(diào)控
    四、病毒基因組的復制
    五、病毒蛋白的合成
    六、轉(zhuǎn)基因動物中的HBV致病性
    七、重排序列的不穩(wěn)定性
   第十五章 肝炎病毒基因組的PCR擴增
    第一節(jié) PCR技術的原理
    一、PCR技術的理論根據(jù)
    二、PCR技術的基本過程
    三、PCR技術的影響因素
    四、PCR技術的類型
    第二節(jié) 幾種新型的PCR技術
    一、定量PCR技術
    二、原位PCR技術
    三、SISPAPCR技術
    第三節(jié) HCVRNA定量PCR技術
    一、標本的倍比稀釋法
    二、競爭性逆轉(zhuǎn)錄PCR技術
    三、放射性核素摻入法
    四、HCVRNA定量檢測的應用
    第四節(jié) PCR技術在乙肝病毒研究中的應用
    一、檢測微量HBVDNA
    二、抗病毒療效的評價
    三、用于HBsAg亞型的研究
    四、血液及血制品安全性的研究
    五、鑒定HBsAg陰性的HBV感染者
   第十六章 抗肝炎病毒的基因治療
    第一節(jié) 基因治療概述
    一、基因治療的策略
    二、基因治療的條件
    三、基因治療的操作步驟
    四、影響基因治療的因素
    五、病毒性肝炎基因治療的整體構(gòu)想
    第二節(jié) 細胞內(nèi)免疫抗病毒基因治療
    一、細胞因子轉(zhuǎn)基因表達
    二、抗病毒蛋白的轉(zhuǎn)基因表達
    三、病毒特異性抗體轉(zhuǎn)基因表達
    四、反式調(diào)節(jié)機制抗病毒基因治療
    五、反義技術抗病毒基因治療
    第三節(jié) 細胞自殺機制的抗病毒基因治療
    一、細胞自殺機制設計思路
    二、病毒主導性酶藥物預施療法
    三、白喉毒素的轉(zhuǎn)基因表達
    四、細胞程序化死亡機制
    五、細胞自殺機制設計的應用
   第十七章 抗肝炎病毒的反義技術
    第一節(jié) 反義技術的概念
    一、反義技術的定義
    二、原核細胞中的反義分子
    三、真核細胞中的反義分子
    第二節(jié) 反義分子的種類和來源
    一、反義分子的種類
    二、反義分子的來源
    第三節(jié) 反義技術的原理和應用
    一、反義技術的原理
    二、反義技術的應用
    第四節(jié) 反義技術抗肝炎病毒的作用靶位
    一、甲肝病毒基因組位點
    二、乙肝病毒基因組位點
    三、丙肝病毒基因組位點
    四、丁肝病毒基因組位點
    五、戊型肝炎病毒基因組位點
   第十八章 抗肝炎病毒的寡核苷酸
    第一節(jié) 寡聚核苷酸的種類
    一、n－ODN
    二、修飾的ODN
    三、ODN與其它反應基團的結(jié)合
    第二節(jié) 反義寡核苷酸的作用機制
    一、反義寡核苷酸的作用靶分子
    二、反義寡核苷酸的作用類型
    第三節(jié) 反義寡核苷酸的藥代動力學
    一、一般原理
    二、定量分析方法
    三、體外資料
    四、體內(nèi)資料
    五、藥物毒性
    第四節(jié) 寡核苷酸的合成
    一、反義寡核苷酸人工合成的發(fā)展
    二、核昔酸合成的策略
    三、核酸小片段的化學合成
    四、核酸小片段的酶促合成法
   第十九章 抗肝炎病毒的核酶技術
    第一節(jié) 核酶概述
    一、核酶的發(fā)現(xiàn)
    二、核酶的基本結(jié)構(gòu)
    三、核酶裂解反應條件
    四、核酶催化的酶學性質(zhì)
    五、核酶RNA的來源
    第二節(jié) 核酶的分子設計
    一、靶鏈的選擇
    二、裂解位點
    三、側(cè)翼序列
    四、活性中心化學修飾
    五、載體序列
    六、啟動子序列
    七、順式和反式核酶
    八、二級結(jié)構(gòu)
    第三節(jié) 抗肝炎病毒的應用
    一、抗HAVRNA核酶技術
    二、抗HBV核酶技術
    三、抗HDV核酶技術
   索引